成为“第三次冲击”元凶的碇真嗣，变得像废人一样……真嗣还能振作起来吗？2012年《福音战士新剧场版：Q》之后，这部动画讲述了被封印的故事的后续

小时候，日向翔阳从电视上看见排球比赛，乌野高中的一名小个子在球上的英姿，简直就是个“小巨人”他对此印象非常深刻，并开始迷上排球，一直想成为“小巨人”一样的人。初中时排球部不够人

少女成濑顺（水濑祈 配音）有着一段不堪回首的童年往事，曾经，年少无知的她因为口无遮拦，导致了家族的悲剧，而她本人亦被封印了言语，无法再开口说话这样的顺终日生活在悲伤之中，和所有

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自古以来，生灵万物自出生时就带来了两股能量——幸福的能量和不幸的能量然而日本的佛女津市这两股能量的平衡却遭到了破坏。神明界掌管幸运与不幸平衡的穷神会派出穷神红叶（内山夕实 饰）

　　东田大辅（中村悠一 配音）是一位平凡不起眼的男子，因为家境实在贫困，于是不得不来到一间家庭餐厅打工以维持生计。东田虽然其貌不扬，却有着十分认真踏实的性格，因此深受上司和后辈

期望不受束縛自由自在生活的遙，與最好的夥伴們迎來高中最後的夏天因為看不到畢業後的將來而感到迷茫，無法集中精神，繼而與擔心他的真琴等人爭吵起來。和這群無可取代的同伴們有着深厚牽絆

梦想成为竞泳选手踏上世界舞台的少年．松冈凛从澳洲回国之后，以实力加入鲛柄学园游泳部并成为重要的一员。曾经最好的对手兼伙伴宗介突然出现，两人因为能再度一同游泳而感到高兴，但谁都不

延续TV版的主线剧情，继续讲述从战场回来的少女薇尔莉特·伊芙加登为了理解“爱”的含义而从事为有需要的人们写信传情的工作薇妹一直挂念的少佐的下落大概率会在这部剧场版中讲述。